Люди в черном, тайная организация на страже покоя и безопасности Земли, уже не раз защищали нас от нападения отбросов Вселенной. На этот раз самая большая опасность для мирового сообщества, которой агентам предстоит противостоять — шпион в их рядах.

Паранормальный сыщик Ник Мун начинает расследование, ради которого придётся окунуться в тайный мир монстров и зловещих ночных созданий, для того чтобы найти древний артефакт с невиданными силами.

Четверо подростков-неудачников поневоле становятся союзниками, когда их отдых в летнем лагере прерывает вторжение пришельцев. И теперь подростки должны объединиться, преодолеть свои страхи и неуверенность и действовать как одна команда для того, чтобы попытаться спасти мир.

Джин становится опасна для общества, поскольку в любой момент может в ней проснуться Темный Феникс и причинить огромный ущерб человеческой цивилизации. Вскоре в молодой особе просыпается темная сущность и профессор теряет из вида свою новую ученицу.

Мир уничтожила эпидемия. Укрывшийся в бункере робот находит возможность вырастить в безопасности человеческого ребенка. Однажды снаружи к ним прорывается женщина, которая расскажет подросшей девочке, что среди людей есть выжившие, а роботам доверять нельзя.

Трое друзей внезапно выясняют, что всё население их города стало странно себя вести, как-будто людей заменили их точными копиями. Вскоре ребятам придется поближе познакомиться и с причиной подмен - злобными существами, которые явно нацелились захватить мир.